Не нашел этого в интернете, поэтому делюсь лайфхаком.
Бывает, что в Scribus координаты уезжают неизвестно в какие дали (например, -9000 у меня было). Что с этим делать совершенно непонятно.
Чтобы это исправить надо проделать следующее.
Для начала включить линейки.
Далее в месте пересечения вертикальной и горизонтальной линеек кликните правой кнопкой мыши, из контекстного меню выберите нужный вам вариант, либо выберите сброс настроек.
Готово, координаты вернутся в норму.